En France, le criblage, c’est-à-dire l’analyse de tests pour déterminer le variant à l’origine de l’infection permet de suivre la part des variants. Depuis le début du mois de juin 2021, lors du criblage trois mutations d’intérêt étaient recherchées : la mutation E484K (variants Bêta et Gamma), la mutation E484Q (très rare) et la mutation L452R (propre à plusieurs variants dont le variant Delta).

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Au mois de décembre, Santé publique France a demandé aux laboratoires de faire évoluer les protocoles afin de mieux déceler le variant Omicron. Désormais la recherche des mutations du code D (DEL69/70, K417N, S371L-S373P ou Q493R), plus spécifiques d’Omicron permettent de connaître la part de variant Omicron parmi les tests criblés dans les départements.

Pour la période allant du 2 au 8 janvier 2022 (dernières données disponibles), la part du variant Omicron parmi les tests criblés s’élève à 88 % en moyenne en France. Voici la carte qui présente ces résultats par départements.

Dans la région Nouvelle-Aquitaine, le taux moyen des tests avec une suspicion forte du variant Omicron est de 90 %. Il dépasse même ce chiffre dans six départements : la Creuse (94 %), les Pyrénées-Atlantiques (93 %), la Haute-Vienne (92 %), la Charente-Maritime (91 %), la Gironde (91 %) et les Landes (91 %). C’est dans le Lot-et-Garonne que la part du variant Omicron est la plus faible, mais largement majoritaire, à 77 %.

voir la carte lien article sud ouest https://www.sudouest.fr/sante/coronavirus/covid-19-en-france-la-carte-du-variant-omicron-dans-les-departements-tres-majoritaire-dans-le-sud-ouest-7664420.php